清代：中央政府对西藏的主权行使达到十分完备程度

　　从西藏历史发展脉络来看，大凡中央政权更替，西藏地方政教首领都要积极向中央政权表示臣服的态度。他们也十分明白，誰最先由中央政权认可并得到皇帝的赐封，谁就会抢得执政西藏的先机。

　　明末，青海的蒙古势力固始汗控制了西藏，支持格鲁派建立了甘丹政权。清入主中原以后，格鲁派首领抢先一步进京寻求中央的认可。顺治十年，五世达赖进京觐见皇帝，顺治帝赐予金册金印，册封为“西天大善自在佛所领天下释教普通瓦赤喇喇达赖喇嘛”。自此，清王朝正式确认了达赖喇嘛在西藏各教派中的领袖地位，也是从那时起，历辈达赖喇嘛经过中央政府的册封遂成为制度。

　　五世达赖圆寂后，执政的桑结嘉措秘不发丧15 年，直到清军平息噶尔丹叛乱，从俘虏口中得知五世达赖早已圆寂。康熙严辞责问，令桑结嘉措立即扶持六世达赖仓央嘉措到布达拉宫坐床。这段时间，由于原来执政西藏的青海蒙古势力与西藏地方势力矛盾加剧，先是桑结嘉措被固始汗孙子拉藏汗所杀，尔后，准噶尔进兵西藏，拉藏汗又死于准噶尔乱兵刀下。清朝震动，康熙调清军近万人进藏平息了准噶尔叛乱。

　　康熙意识到须从制度上治理西藏，于是废除了蒙古汗王在西藏的特权，由清朝中央对西藏直接统管，从西藏贵族中选用4 名有功者任命为“ 噶伦”，代行达赖掌管世俗政权。雍正五年（1727年），清朝在西藏正式设立了驻藏大臣，确定了青海、四川、云南等藏区与西藏的行政边界。

布达拉宫壁画：五世达赖朝晋顺治皇帝。

　　1791年，廓尔喀人大举入侵西藏，占领后藏并洗劫了扎什伦布寺。乾隆派福康安率17000多清军进藏驱逐了廓尔喀人，兵临加德满都城下，迫使廓尔喀人乞降。清军班师拉萨后，奉乾隆旨，将勾结廓尔喀人的红帽活佛，在拉萨当众剥去黄衣，砍头正法，并将此教派解散。

　　乾隆决定以此为契机，改革西藏政教体制，立定藏事规程，谕示福康安等人“将来撤兵后，必当妥立章程，以期永远遵循。”福康安会同驻藏大臣与八世达赖喇嘛，就章程逐条商议，然后呈报乾隆御批，正式颁布了《钦定藏内善后二十九章程》。

　　二十九条章程十分重要的内容之一是建立了大活佛金瓶掣签制度。藏传佛教转世活佛众多，良莠不齐，私下交易等弊端时有发生。乾隆亲自设计了金瓶掣签制度，即在释迦牟尼像前，置放特制金奔巴瓶，由驻藏大臣监督主持，将多个候选达赖喇嘛、班禅及藏区各地呼图克图灵童的名字生辰年月，以满、汉、藏三种文字书于象牙签牌上，然后置于金瓶之中，当众掣出，报请皇帝或中央政府正式批准。

　　二十九条章程无疑是清王朝对西藏行使完全主权的法律性文献，也是清王朝治理西藏最完备的一个法典性文件，有效治理西藏200多年。