我国在产业结构方面存在的主要问题是：一、二、三产业发展不协调，一产不稳、二产不强、三产不足；各产业内部结构不合理。在第一产业发展中，国家对农业基础设施投入不够，农业基础设施薄弱，还不能从根本上解决靠天吃饭的问题；经营单位规模小，经营分散，现代化农牧业比重小、水平低；在工业发展中，某些行业产能严重过剩，高耗能产业发展过多、过快，传统产业技术水平低、战略性高新技术产业发展慢；第三产业的发展相对滞后，现代服务业比重低，特别是生产性服务业的发展没有得到足够重视。地区产业结构存在趋同现象。产业组织结构还不合理，“大而全”、“小而全”的现象仍然严重。

　　产业结构存在的这些问题在经济发展方式方面凸显了出来。我国农业的劳动生产率低，占40%以上的农业劳动力只提供了10%的国内生产总值。工业企业的自主创新能力不强，核心竞争力弱，产品附加值不高，缺乏知名品牌；多数企业过度依靠工人的低收入，能源、原材料的低价格，环境保护的低投入获得利润；资源消耗高、浪费大、环境破环和污染严重。在经济增长动力上，过度依靠投资和出口拉动经济。从长期看，这种发展方式是不可持续的。

　　但也必须看到，调整产业结构，转变经济增长方式还存在许多“两难”选择。比如，经济增长速度与效益、就业的关系。由于当前我国是一种粗放型经济，只有保持一定的经济增长速度，企业才能获得高额的利润，国家才能有高增长的财税收入，就业难的问题才能得到缓解。2008年至2009年我国的经济增长速度有所下降，这本是调整和优化产业结构的好时机，但为了不使经济增长速度回落过多、过快，我们又不得不出台一些措施去保增长、保速度，使一些本应破产的企业又活了过来，也使投资和消费的结构更趋恶化。如何既能保持一定的增长速度，又能促进产业结构的调整和经济发展方式的转变，始终是我国经济发展面临的“两难”选择。

　　在发展劳动密集型产业和资金、技术密集型产业上，我们也面临“两难”选择。很显然，在相当长的时期内我国发展劳动密集型产业比发展资金、技术密集型产业更具优势。但作为一个大国，经济的国际化程度越来越高，为了国家安全和国计民生的需要，保持经济的可持续发展，实现工业化和现代化，增强国际竞争力，我们又必须发展资金、技术密集型产业，促进产业升级。

　　扩大内需和增加出口、发展重化工业和节能减排、发挥地区优势和区域协调发展等问题，我们也面临“两难”选择。它们增加了我们调整和优化产业结构，促进经济发展方式转变的难度，决定了这项战略任务的长期性、复杂性。

　　熊掌与鱼难以兼得。在处理短期利益和长远利益、短期高速发展和长期可持续发展的关系时，我们需要统一思想、排除困难，下决心牺牲一些短期发展和利益，来推进产业结构调整和经济发展方式转变。