摘要：1949年11月中国科学院（以下或简称"科学院""中科院"）成立。作为国家最高科学研究机构，国家始终要求科学研究为国民经济服务，而科学研究的属性和科学家的追求则是希望在基础科学或科学理论上做出贡献，两个不尽相同的目标难免使科学院的农业研究陷入尴尬，并且这种尴尬随着政治形势的变化，呈现阶段性的特点，特别是1957年中国农业科学院成立之后。如何找准自己的定位，扮演好自己的角色，科学院试图通过不断地调整办院方针，在基础研究和应用开发方面保持某种平衡来化解尴尬。经过较长时间的摸索，科学院在农业研究领域也形成了自己在综合和应用基础研究领域的特色，并且也取得了不俗的成绩，但尴尬依旧存在。回顾中国科学院涉农工作的历史，发现科学院的农业研究无论是在重视应用研究时期，还是在重视基础研究时期，都会遭遇不同程度的尴尬，甚至至今仍然没有摆脱尴尬的境地。论文进一步从更为宽广的角度去审视这种尴尬的深层次意义，包括学术的价值取向，延安自然科学院的争论，中央研究院和李先闻的个例。报告也回顾了中国科学院在化解尴尬方面所做的努力，以及这种努力所取得的成就及预期等。

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